Les fleurs de Millepertuis sont utilisées en médecine traditionnelle depuis l'Antiquité.
En interne, il est recommandé pour : les névroses, l'anxiété, la dépression, la mélancolie. Le Millepertuis rééquilibre et tranquilise.
En externe, c'est un excellent anti-inflammatoire de la peau et surtout des muqueuses, il a des propriétés cicatrisantes, antiseptiques et anti-infectieuses.